位於海岸公園投放區的管理 在海岸公園內捕魚須領有牌照,這牌照只發給在附近生活的漁民,在投放人工魚礁前,經已與各持牌人達成自願性質的協議,不在人工魚礁範圍捕魚。
第二期人工魚礁區的管理 (未來的漁業保護區 ) 計劃會將外牛尾海及大灘海的人工魚礁區劃成為未來的漁業保護區的一部份,並以「禁捕區」形式來管理。